Lancet Oncol:肾表面细胞癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2022-02-07 02:19:49 来源:
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一.科学研究背景

成年人与肺紫色肝细胞胃癌 (ccRCC)的可能性减少有关,但成年人又矛盾地与该的肾功能改善有关,其潜在有助于由此可知不明确。现作者对成年人病症和经常性运动量病症在原发和突起周胆固醇四组织起来里面的甲状腺填充和免疫基因表达四组相似之处开展科学研究量化。

本文简述了等位基因注记达引起的微环境的相似之处有助于暗示成年人病症的求生存军事优势(成年人悖论)。

二.量化流程三.社论讲解1.COMPARZ链注记、TCGA-KIRC链注记、MSK免疫外科手精链注记数据抽取、纠正

在COMPARZ链注记的453名病症里面,有375名(83%)病症带有可用的脱氧核糖核酸数据,外科手精前BMI测量以及无进展和各个方面求生存数据开展量化(注记1)。除119名(26%)以致于病症外,来自COMPARZ试验的此后链注记有数256名(68%)病症(n=256)。

注记1.COMPARZ针灸试验链注记的人口统计统计学和针灸特征

TCGA-KIRC链注记里面的332同上病症里面,量化报告了经肺切除精外科手精的152同上(46%)早期(即AJCC III和IV期)ccRCC病症的针灸和人口统计统计学数据(注记2)。在考虑到59名(39%)以致于病症后,再次获的链注记有数93名病症(n=93)。

注记2.早期紫色肝细胞肺肝细胞胃癌TCGA-KIRC链注记的社会学和针灸特征

从62同上MSK周围胆固醇四组织起来链注记里面开展肺脏切除精的非心肌梗死紫色肝细胞RCC病症里面获了继发性和周围胆固醇试样。在这个链注记里面,从59名病症的PNN(肺周不远处)周围胆固醇,25名病症的PNA(远离肺周)周围胆固醇以及55名病症的四组织起来里面频域。在考虑到以致于病症此后,此后链注记有数41名(69%)PNN频域病症, PNA频域为17(68%),频域为37(67%)。从以前的203名加入者的MSK免疫外科手精科学研究人;也里面考虑到74名(36%)以致于病症后,总求生存量化的此后链注记有数129名(64%)加入者(注记3)(n=129)。

注记3. 使用MSK免疫外科手精的针灸试验链注记的人口统计统计学和针灸特征

2.成年人的肺紫色肝细胞胃癌病症近似于经常性运动量的肺紫色肝细胞胃癌病症总求生存期很短

根据KM求生存量化,在三四组里面都找到成年人病症的总求生存期很短。在TCGA-KIRC链注记里面,经分期录入后,成年人病症的各个方面存活期长于经常性运动量四组;在COMPARZ链注记里面,经IMDC可能性低分录入后,胖病症的各个方面存活期也长于经常性运动量四组。在MSK免疫疗法链注记里面,经IMDC可能性低分录入后,BMI与发病率的无明显相似之处(如上图1)。

上图1.TCGA-KIRC链注记 (A)、COMPARZ 链注记(B)和MSK免疫外科手精链注记(C)的总求生存期

3.COMPARZ链注记里面成年人病症带有较好的PFS

对CPMPARZ链注记KM量化后,KM曲线揭示,COMPARZ链注记里面成年人病症比经常性运动量病症带有较好的PFS。

上图S1.COMPARZ链注记里面成年人病症比经常性运动量病症带有较好的PFS

4.用于一线药剂外科手精,成年人病症仍带有较好的OS

KM曲线揭示了在用于一线酪氨酸嘌呤抗病毒(pazopanib或Sunitinib)的两个外科手精四组里面,成年人病症的OS仍然较经常性运动量病症好。

上图S2.COMPARZ链注记用于一线药剂外科手精四组的总求生存期量化

5.COMPARZ链注记里面,成年人与经常性运动量的病症基因表达四组等位基因特征普遍存在明显相似之处

要用完上述量化,作者在三个链注记里面确认成年人悖论普遍存在此后,接下来在COMPARZ链注记里面对成年人和经常性运动量病症量化报告了基因表达四组学相似之处。先是要用了Hallmark等位基因集的GSEA量化,比较成年人病症与经常性运动量病症彼此间的相似之处:成年人病症里面揭示氧气、TGF-β、上皮-间充质转变和甲状腺填充信号通路明显上调,提示伤口下颚种系统的激活(上图A)。上图B是对上图A筛选的几个等位基因注记达通路的Enrichment plots。

上图S4.COMPARZ链注记里面成年人病症与经常性运动量病症的ccRCC基因表达四组等位基因特征普遍存在明显相似之处

6.COMPARZ链注记与TCGA-KIRC链注记 里面成年人比经常性运动量病症的甲状腺填充低分极低

在GESA衍生的特征等位基因集甲状腺填充低分比较里面,成年人病症大于经常性运动量病症(如上图2)。

上图2.COMPARZ链注记(A)与TCGA-KIRC链注记 (B)里面成年人原发病症与经常性运动量病症的甲状腺填充的z score

7.经常性运动量与成年人病症的免疫肝细胞;也无明显相似之处

对经常性运动量(7同上)与成年人(16同上)病症的原发的主要免疫肝细胞数量均使用流式肝细胞精开展量化报告。上图A揭示了成年人病症与经常性病症彼此间的免疫肝细胞;也的各个方面相似之处。上图B明确揭示了成年人和经常性运动量病症T肝细胞;也的诱发各个方面。找到经常性运动量与成年人病症的免疫肝细胞;也无明显相似之处,免疫肝细胞诱发的素质与BMI无关。

上图S9.用流式肝细胞精量化经常性运动量与成年人病症的免疫肝细胞;也无明显相似之处

8.与经常性运动量病症相比,成年人病症突起周胆固醇四组织起来发炎减少,尤其是不远处的突起周胆固醇

在MSK的非心肌梗死ccRCC病症的前瞻性链注记里面,作者更名了20个最明显的丰富的IPA规章通路,这些通路来自于成年人和经常性运动量病症的PNN和PNA频域的比较(上图A)。成年人和经常性运动量病症的PNN和PNA频域彼此间的免疫诱发(ssGSEA低分)比较(上图B)。

上图S5.与经常性运动量的病症相比,成年人病症的肺周胆固醇揭示出发炎和氧气减少

综上,在COMPARZ试验链注记里面,经过IMDC可能性低分变动后,找到近似于经常性运动量病症,酪氨酸嘌呤抗病毒外科手精提极低了成年人病症的求生存率,尤其是不感兴趣sunitinib外科手精的病症。IMDC可能性低分模型包含的四组分间接反映寄主因素对乳胃癌系统性发炎抑制作用(同上如性疾病,里面性粒肝细胞增多,和血小板增多症),这些因素不太可能也是免疫外科手精结果和BMI彼此间关联有助于的主因。找到成年人病症的甲状腺填充分数大于经常性运动量病症,与之前其他的科学研究结果注记明的,加入甲状腺填充,β-水解种系统等等等位基因的富集的现象一致。因此,甲状腺填充的相似之处可以部分暗示成年人病症不感兴趣酪氨酸嘌呤抗病毒外科手精后的较好肾功能。

此科学研究为成年人悖论提供了免疫学支持。在抑郁症ccRCC的病症注意到到成年人病症近似于经常性运动量的病症微环境的相似之处:尤其是成年人病症的的甲状腺填充减少,但各个方面发炎无明显相似之处。没人注意的是成年人病症的周围胆固醇揭示减少的发炎和氧气状况。紫色肝细胞胃癌与突起周胆固醇四组织起来微环境的简单相互抑制作用不太可能带有针灸意义,没人进一步科学研究。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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